Przewodnictwo Komisji obejmowane jest każdorazowo na okres trzech lat przez Delegację jednej ze Stron Umowy. Delegacja, która w danym okresie sprawuje przewodnictwo, wyznacza Przewodniczącego Komisji. Przewodniczący reprezentuje Komisję, prowadzi zwyczajne i nadzwyczajne posiedzenia Komisji, jak również narady Przewodniczących Delegacji.
W pierwszym okresie działalności MKOOpZ, tzn. do końca roku 2001 , obejmującym również okres "tymczasowy" (1996 - 1999), przewodnictwo Komisji sprawowała Delegacja Rzeczpospolitej Polskiej. Funkcję Przewodniczącego MKOOpZ w tym okresie pełnili: Leszek Bagiński, Radosław Gawlik i Janusz Zaleski.
W latach 2002 - 2004 Komisji przewodniczył pan Jaroslav Kinkor reprezentujący Delegację Republiki Czeskiej. Z kolei w latach 2005 – 2007 przewodnictwo w MKOOpZ objęła Republika Federalna Niemiec, a funkcję Przewodniczącego pełnił pan Thomas Stratenwerth. Delegacja Rzeczpospolitej Polskiej objęła przewodnictwo w latach 2008 - 2010. Na Przewodniczącego Komisji mianowano pana Mariusza Gajdę, a następnie w styczniu 2008 r. stanowisko to powierzono panu Januszowi Zaleskiemu.
Na 13 Plenarnym Posiedzeniu Komisji w dniu 7 grudnia 2010 r. nastąpiło oficjalne przekazanie przewodnictwa pomiędzy Rzeczpospolitą Polską a Republiką Czeską. Od
1 stycznia 2011 r. funkcję Przewodniczącego Komisji sprawuje pan Pavel Punčochář.
Skład Delegacji Rzeczpospolitej Polskiej: | Nazwisko | Imię | Instytucja | Funkcja | | Wiśniewski | Janusz | Krajowy Zarząd Gospodarki Wodnej,
Warszawa | Przewodniczący Delegacji | | Zaleski | Janusz | Wrocławska Agencja Rozwoju Regionalnego, Wrocław | członek Delegacji | | Kreft | Andrzej | Regionalny Zarząd Gospodarki Wodnej w Szczecinie | członek Delegacji | | Zięba | Stanisław | Dolnośląski Urząd Wojewódzki,
Wrocław | członek Delegacji |
| Winter | Jan | Instytut Meteorologii i Gospodarki Wodnej,
Warszawa | członek Delegacji |
Skład Delegacji Republiki Federalnej Niemiec:
| Nazwisko |
Imię |
Instytucja |
Funkcja |
| Jekel |
Heide |
Bundesministerium für Umwelt, Naturschutz und Reaktorsicherheit, Bonn |
Przewodnicząca Delegacji |
| Beyer |
Knut |
Bundesministerium für Umwelt, Naturschutz und Reaktorsicherheit, Bonn |
zastępca Przew. Delegacji |
| Herpertz |
Dorothe |
Bundesministerium für Verkehr, Bau- und Stadtentwicklung,
Referat WS 14,
Bonn |
członek Delegacji |
| Socher |
Martin |
Sächsisches Staatsministerium
für Umwelt und Landwirtschaft,
Dresden |
członek Delegacji |
| Augustin |
Kurt |
Ministerium für Umwelt, Gesundheit und Verbraucherschutz (MUGV)
des Landes Brandenburg,
Potsdam |
członek Delegacji |
| Borchers |
Thomas |
Bundesministerium für Umwelt,
Naturschutz und Reaktorsicherheit,
Bonn |
członek Delegacji |
Skład Delegacji Republiki Czeskiej:
| Nazwisko |
Imię |
Instytucja |
Funkcja |
| Punčochář |
Pavel |
Ministerstvo zemědělství ČR,
Praha |
Przewodniczący Komisji |
| |
|
|
Przewodniczący Delegacji |
| Král |
Miroslav |
Ministerstvo zemědělství ČR,
Praha |
zastępca Przew. Delegacji |
| Trdlica |
Luděk |
Výzkumný ústav vodohospodářský TGM Praha,
pobočka Ostrava |
członek Delegacji |
| |
|
|
członek Delegacji |
Rozliczenie finansowe MKOOpZ za dany rok sprawdzane jest przez trzech rewidentów rachunkowych, zaproponowanych przez Delegacje i mianowanych przez Komisję na trzyletnią kadencję. Obecnie funkcję tę pełnią: ze strony Delegacji Polskiej - pan Andrzej Żyłajtys, ze strony Delegacji Niemieckiej - pan Hubert Gladbach, a ze strony Delegacji Czeskiej - pani Petra Tachecí.
|
